| Ausführung | 1.01 |
|---|---|
| Herausgeber | Paul A. Wilson |
| Veröffentlichungsdatum | 25.08.2008 |
| Datum hinzugefügt | 11.08.2004 |
| Os Anforderungen | Macintosh, Mac OS X 10.3 |
| Bedarf | Mac OS X 10.3 |
| Downloads insgesamt | 29 |
| Preis | Free |
Beschreibung
Befehlszeilentool zum Vergleichen von kommagetrennten Datendateien unter Verwendung relativer Unterschiede, um die ähnlichsten Konformationen zu ermitteln. Compsort vergleicht die Datendateien anhand des relativen Unterschieds, berechnet einen Ähnlichkeits-Score, sortiert die Scores in aufsteigender Reihenfolge (niedrigere Werte stehen für größere Ähnlichkeit), speichert die Anzahl X niedriger Scores.
Die vom Benutzer erstellten Datendateien müssen kommaseparierte Textdateien sein. Jede Datei repräsentiert ein einzigartiges Molekül. Jede Zeile in einer Datei repräsentiert eine einzigartige Konformation des Moleküls. Die erste Spalte in der Datendatei muss ein Etikett sein, das für die durch die Zeile dargestellte Konformation eindeutig ist. Der Rest der Spalten sind numerische Deskriptoren, wie z. B. Entfernungsraummessungen.
Die Zeilen werden kombinatorisch zwischen Dateien verglichen. Die Labels im Vergleich werden verkettet und mit den Bewertungen für den Zeilensatz gespeichert. Dies stellt eine Möglichkeit bereit, die Konformationen zu identifizieren, die einen gegebenen Ähnlichkeitswert erzeugt haben.
Zukünftige Arbeiten umfassen:
GUI-Schnittstelle hinzufügen
Beitrag zu meinem 3D-Pharmakophor-Modellierungsalgorithmus
Eine parallele Version mit MPI