GATE

Beschreibung

GATE (Grid Analysis of Time-Series Expression) ist eine integrierte Computersoftwareplattform für die Analyse und Visualisierung hochdimensionaler biomolekularer Zeitreihen. GATE verwendet einen korrelationsbasierten Clustering-Algorithmus, um molekulare Zeitreihen auf einem zweidimensionalen hexagonalen Array anzuordnen, und färbt einzelne Sechsecke dynamisch entsprechend der Expressionsebene der molekularen Komponente, der sie zugeordnet sind, um animierte Filme von molekularen Systemen auf Systemebene zu erstellen Regulierungsdynamik. Um aus Korrelationsmustern auf mögliche regulatorische Kontrollmechanismen zu schließen, ermöglicht GATE auch die interaktive Abfrage von Filmen gegen eine Vielzahl von Datensätzen mit Vorwissen. GATE-Filme können angehalten werden und sind interaktiv, sodass Benutzer Netzwerke rekonstruieren und funktionale Anreicherungsanalysen durchführen können. Mit GATE erstellte Filme können im Flash-Format gespeichert und als interaktive Figuren direkt in PDF-Manuskriptdateien eingefügt werden.