MonaLisa

Beschreibung

MonaLisa ist ein Petrinetz-basiertes Werkzeug zur Analyse biochemischer Netzwerke. Es umfasst einen Editor, der durch eine intuitive Visualisierung und Animation unterstützt wird, sowie verschiedene Analysetechniken, die sich auf Netzwerkzerlegung und Knockout-Analyse konzentrieren. Es umfasst die Berechnung von Elementarmodi (T-Invarianten), P-Invarianten, Maximal Common Transition Sets (MCT-Sets), T-Clustern, Minimal Cut Sets (MCS), Gradverteilung und Clusterkoeffizientenverteilung.

MonaLisa unterstützt Schnittstellen für verschiedene systembiologische und graphentheoretische Formate SBML, KGML, PNT, APNN, MetaTool und PNML.