| Herausgeber | David Rosenkranz |
|---|---|
| Veröffentlichungsdatum | 06.05.2013 |
| Datum hinzugefügt | 06.05.2013 |
| Os Anforderungen | Windows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Bedarf | None |
| Downloads insgesamt | 64 |
| Preis | Free |
Beschreibung
proTRAC ist ein einzigartiges und praktisches Tool zur probabilistischen Erkennung, Visualisierung und Analyse von piRNA-Clustern. proTRAC zeigt eine höhere Sensitivität und Selektivität im Vergleich zu bisher angewandten Methoden zur Clusterdetektion. Die Signifikanz der beobachteten Sequenz-Read-Trefferdichte, Strangverzerrung, Menge an Loci, die selten kartierten Sequenz-Reads entsprechen, Anzahl an Loci mit T an Position 1 oder A an Position 10 und die Anzahl an Loci innerhalb des typischen piRNA-Längenbereichs (26- 32nt) berücksichtigt. Die beobachteten Eigenschaften von Clusterkandidaten werden anhand des gegebenen Datensatzes bewertet und einem probabilistischen Scoring-System unterzogen.
