Optogenetics Pro for iPhone

Beschreibung

Optogenetik ist ein Werkzeug, das einen Forscher bei der Berechnung der erforderlichen optischen Leistung für ein bestimmtes In-vivo-Experiment unterstützt, das Optogenetik oder einen anderen experimentellen Ansatz umfasst, der die Lichtabgabe an tiefe Gehirnbereiche über optische Fasern umfasst. Verschiedene Hirnareale haben unterschiedliche optische Eigenschaften, die bestimmen, wie Licht gestreut und verteilt wird, sobald es die optische Faser verlässt. Um die für ein bestimmtes experimentelles Design erforderliche Lichtmenge abzuschätzen, sind Kenntnisse über die spezifischen Streueigenschaften der ausgewählten Gehirnregion, das spezifische zu verwendende Opsin und die Eigenschaften der optischen Faser erforderlich. Sobald ein Benutzer diese Parameter in die APP eingibt, berechnet sie die maximale Tiefe, bei der eine Erregung des Opsins zu erwarten ist. Die Eindringtiefe wird als Funktion der optischen Leistung (mW) aufgetragen, sodass ein Benutzer sehen kann, wie Licht unter bestimmten Umständen im Gehirngewebe gestreut wird. Version 2 unterstützt 17 verschiedene Opsine und einen vollständigen Lichtstreuungsgehirnatlas für die erwachsene Maus, der es einem Benutzer ermöglicht, den Gehirnbereich seiner Wahl nachzuschlagen und den spezifischen Streuungskoeffizienten für diesen bestimmten Bereich zu lesen. Für die wissenschaftliche Grundlage davon Taschenrechner, siehe Al-Juboori, Dondzillo, Stubblefield, Felsen, Lei und Klug: Lichtstreuungseigenschaften variieren über verschiedene Regionen des erwachsenen Mausgehirns. PlosONE, im Druck. Ein Benutzerhandbuch und weitere Informationen finden Sie unter www.optogeneticsapp.com. Eine Pro- und eine Lite-Version sind verfügbar. Die beiden Versionen sind identisch mit der Ausnahme, dass die Pro-Version einen vollständigen Gehirnatlas enthält, der aus 43 Bildern/Tafeln besteht, während die Atlas-Lite-Version nur 5 Tafeln enthält.