Ascalaph Designer

Beschreibung

Ascalaph Designer ist ein Allzweckprogramm für molekulardynamische Simulationen. Unter einer einheitlichen grafischen Umgebung werden als eigene Implementierung der Molekulardynamik sowie die Methoden der klassischen und Quantenmechanik populärer Programme dargestellt. Zu den Funktionen gehören Molekulargrafiken: mehrere Fenster, zwei Kameras pro Modell, CPK, Wireframe, Stick, Ball and Stick und CPK Wireframe-Stile, Molekularmodellerstellung: Crystal Builder, Chain Builder, Zeichnen per Maus, Bearbeitung der Molekulargeometrie, vorläufige Optimierung , Quantenoptimierung und Kollisionsentfernung, Molekulargeometrieoptimierung mit konjugierten Gradientenmethoden, Molekulardynamik: Mehrzeitschrittintegration, Integration vierter Ordnung, Supercomputerberechnungen mit Hilfe von MDynaMix, flexibles SPC-Wassermodell und implizites Wassermodell und Quantenchemie mit Hilfe von CP2K und PC GAMESS/Firefly: Energie, Optimierung der Molekülgeometrie und potenziell abgeleitete Ladungen.