Partition

Beschreibung

Partition ist ein modellbasiertes statistisches Softwarepaket zur Identifizierung von Bevölkerungsunterteilungen (Barrieren für den Genfluss) und zur Zuordnung von Individuen zu Populationen auf der Grundlage ihrer Genotypen an kodominanten Marker-Loci. Geeignete genetische Marker schließen Mikrosatelliten und Allozyme ein. Unverknüpfte oder lose verknüpfte Marker-Loci sollten verwendet werden, so dass die Annahme eines Verknüpfungsgleichgewichts vernünftig ist.

Das zugrunde liegende populationsgenetische Modell ist für die Auskreuzung diploider Organismen geeignet. Es wird davon ausgegangen, dass die Personen in der Stichprobe zu einer Reihe separater Quellpopulationen gehören. Es wird angenommen, dass sich diese Quellpopulationen im Hardy-Weinberg- und Kopplungsgleichgewicht befinden, aber die allelische Zusammensetzung dieser Quellpopulationen und sogar die Anzahl der in der Probe vertretenen Quellpopulationen werden als Parameter behandelt, deren Werte unbekannt sind.