ImageSurfer

Beschreibung

ImageSurfer ist ein kostenloses 3D-Bildgebungsprogramm für die Mikrokopie. Es ermöglicht den Forschern, mehrkanalige 3D- und 4D-Volumina (Zeitraffer) zu visualisieren und zu analysieren. ImageSurfer bietet verschiedene Bildwiederherstellungswerkzeuge, einschließlich Entfaltungsalgorithmen (Wiener-Filter, eingeschränkte iterative und maximale Wahrscheinlichkeit), um durch das Bildgebungssystem verursachte Unschärfen zu beseitigen. Zur Visualisierung bietet ImageSurfer verschiedene Techniken zum Rendern von Volumen und Oberflächen. Die Software verfügt außerdem über einen innovativen farbigen Isoflächenmodus, der eine qualitative Anzeige der Korrespondenz zwischen zwei Kanälen ermöglicht.

Ein "Slice Extractor" ermöglicht es dem Benutzer, einen Querschnitt des Volumens zu untersuchen, der in einer beliebigen Ausrichtung aufgenommen wurde. Das aufgenommene Slice kann als traditionelles 2D-Bild oder als 3D-Reliefdarstellung dargestellt werden, in der die Bildintensität als Höhe codiert ist. Um die räumliche Überlappung zwischen Strukturen weiter zu untersuchen, kann der Prüfer Daten aus einem anderen Kanal verwenden, um die 3D-Reliefdarstellung zu kolorieren. Zur Quantifizierung können dann Signalintensitätswerte in erfassten Schichten entlang eines benutzerdefinierten Splines abgetastet werden. Neben Schnappschüssen von 3D-Darstellungen und dem Generieren von Filmen können 3D-Modelle auch als OBJ- oder VRML-Dateien (Virtual Reality Modeling Language) exportiert werden. VRML-Dateien können in Webbrowsern mit einem kostenlosen Plug-In angezeigt werden. Beide Dateitypen können zur weiteren Verarbeitung in gängige 3D-Rendering-Programme und in Acrobat 3D importiert werden, um Dokumente zu erstellen, die interaktiv mit Adobe Reader 8 angezeigt werden können.