POY

Beschreibung

POY ist ein phylogenetisches Analyseprogramm, das mehrere Arten von Daten unterstützt (z. B. Morphologie, Nukleotide, Gene und Genregionen, Chromosomen und ganze Genome). POY zeichnet sich dadurch aus, dass es echtes Alignment und Phylogenie-Inferenz durchführen kann, d. h. Eingabesequenzen müssen nicht vorausgerichtet werden. Einfügungen, Löschungen und Neuanordnungen können dann in die Gesamtbewertung des Baums unter „Maximale Sparsamkeit“ oder in das Modell unter „Maximale Wahrscheinlichkeit“ aufgenommen werden. Zu diesem Zweck wurden verschiedene heuristische Algorithmen entwickelt und in POY implementiert.